免疫系统在对抗疾病方面起着至关重要的作用，但是它也会患病。临床上以甲亢最为明显。其发病原因不明，但是研究表明甲亢是遗传的。
专家表示，基因因素是引起甲亢的最主要原因。在临床上甲亢患者多为家族性，其子女甲状腺较其他甲亢病原较易感染。尽管它们较容易得甲亢，但并非每个人都会得甲亢，只有另外两种因素的牵涉才会得甲亢。第一，暴露于甲亢原菌，第二，由于过度疲劳或精神因素，自身的抗病能力下降。
临床上最常见的甲亢和中毒性弥漫性甲状腺肿的格雷夫斯病就是甲亢。在免疫理论中，甲亢是一种自体免疫疾病。近代研究表明，甲亢是遗传、感染、心理创伤等应激因素所致。自身免疫性甲状腺炎等自身免疫性疾病是由于抑制性T淋巴细胞功能障碍所致的器官特异性自身免疫性疾病。据调查，60%的病人有家庭素质倾向。
不过，甲亢虽然是遗传性的，却并非%的遗传疾病，不必惊慌。
若发现甲状腺结节、甲亢、甲减、甲状腺炎、甲亢突眼、甲状腺瘤、甲状腺癌(未转移)、甲状腺肿大、甲状腺囊肿等，应及早发现、早治疗，避免对自己或家人造成不良影响。